Das Informationssystem MetaCrop zur Unterstützung systembiologischer Forschung an Kulturpflanzen
| Type of Publication: | Journal article |
| Publication status: | Published |
| Author: | Weise, Stephan; Chen, Jinbo; Junker, Björn; Klapperstück, Matthias; Lange, Matthias; Schreiber, Falk; Scholz, Uwe |
| Year of publication: | 2011 |
| Published in: | it - Information Technology ; 53 (2011), 5. - pp. 234-240. - ISSN 1611-2776 |
| DOI (citable link): | https://dx.doi.org/10.1524/itit.2011.0648 |
| Summary: |
Die stetig wachsende Bedeutung von Kulturpflanzen zur Ernährung und zur industriellen Verwendung erfordert es, deren Eigenschaften kontinuierlich zu verbessern. Zur Unterstützung der lebenswissenschaftlichen Forschung in diesem Bereich wurde das Informationssystem MetaCrop entwickelt, welches Daten über metabolische Netzwerke (Pathways) agronomisch bedeutsamer Organismen verwaltet. Der Fokus des Systems liegt neben der ausschließlichen Verwendung manuell kurierter, und damit qualitativ hochwertiger, Informationen auf der hohen Granularität der gespeicherten Daten, mit der versucht wird, die hohe biologische Komplexität der Pflanzen abzubilden. MetaCrop ist unter der URL http://metacrop.ipk-gatersleben.de verfügbar.
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| Summary in another language: |
Continuously improving crop performance is a crucial necessity due to the growing importance of crop plants as feedstock for both nutrition and industrial use. The information system MetaCrop has been developed to support life science research in this important field. MetaCrop stores data about metabolic pathways of agronomically important crops. The system focusses on the exclusive usage of manually curated and therefore high quality data as well as on a high granularity of the managed information, thus aiming to represent the high biological complexity of plants. MetaCrop is available at the URL http://metacrop.ipk-gatersleben.de.
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| Subject (DDC): | 004 Computer Science |
| Keywords: | information storage; database applications; information search and retrieval |
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WEISE, Stephan, Jinbo CHEN, Björn JUNKER, Matthias KLAPPERSTÜCK, Matthias LANGE, Falk SCHREIBER, Uwe SCHOLZ, 2011. Das Informationssystem MetaCrop zur Unterstützung systembiologischer Forschung an Kulturpflanzen. In: it - Information Technology. 53(5), pp. 234-240. ISSN 1611-2776. Available under: doi: 10.1524/itit.2011.0648
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