Synthese, Charakterisierung und Anwendungen photospaltbarer Fluoreszenzfarbstoff-Dyaden mit intramolekularer Energieübertragung
Synthese, Charakterisierung und Anwendungen photospaltbarer Fluoreszenzfarbstoff-Dyaden mit intramolekularer Energieübertragung
Date
2014
Authors
Editors
Journal ISSN
Electronic ISSN
ISBN
Bibliographical data
Publisher
Series
URI (citable link)
International patent number
Link to the license
EU project number
Project
Open Access publication
Collections
Title in another language
Publication type
Dissertation
Publication status
Published in
Abstract
Diese Arbeit beschreibt die Entwicklung neuer photospaltbarer Fluoreszenzfarbstoff-Dyaden. Der Fokus lag dabei in der Anwendung für materialwissenschaftliche Fragestellungen. Bei den hier beschriebenen Fluoreszenzfarbstoff-Dyaden handelt es sich um ein System aus zwei Fluoreszenzfarbstoffen, die über einen photolabilen Linker verbunden sind. Mittels einer durch UV-Licht induzierten Photoreaktion kann der Linker gespalten werden. Die Farbstoffe der Dyade sind so gewählt, dass zwischen ihnen Förster-Resonanz-Energie-Transfer (FRET) auftreten kann. Es wurden Dyaden mit intramolekularer Energieübertragung synthetisiert, photophysikalisch charakterisiert und in Einzelmolekülexperimenten angewandt.
Zunächst wurden Vorversuche für FRET-Messungen an Systemen, in denen Donor und Akzeptor einen wohldefinierten Abstand besitzen, durchgeführt. Als Modellsysteme dienten ein markierter, hybridisierter Oligonukleotidstrang und ein markierter Oligonukleotid-Einzelstrang. Die über FRET-Messungen im Ensemble bestimmten Abstände zwischen Donor- und Akzeptorfarbstoff der hybridisierten Probe wurden mit den theoretisch berechneten Abständen sowie mit dem über FRET gemessenen Abstand der beiden Farbstoffe am Einzelstrang verglichen. Es konnten Rückschlüsse auf bevorzugte Farbstofforientierungen, die sich auf Wechselwirkungen mit dem Phosphatrückgrat zurückführen ließen, und auf die relativ starke Krümmung des Einzelstrangs gezogen werden.
Daraufhin wurde eine PDI-Carbonsäure sowie drei Fluoreszenzfarbstoff-Dyaden synthetisiert: Pyrrolopyrrolcyanin-Cumarin-Perylendiimid (SCP), Perylendiimid-Methylphen-acyl-Terrylendiimid (PAT) und Perylendiimid-Methylphenacyl-Pyrrolopyrrolcyanin (PAS).
Die Dyaden wurden in Ensemblemessungen photophysikalisch charakterisiert. In allen drei Dyaden konnte eine quantitative Energieübertragung des Donors auf den Akzeptor beobachtet werden. Für das FRET-Paar PDI/PPCy ergab sich ein Försterradius von 5,4 nm, für PDT/TDI wurden 6,8 nm ermittelt. Mit der Dyade PAT konnten in Spaltungsexperimenten unter UV-Bestrahlung gute Ergebnisse erzielt werden. Eine Spaltungsquantenausbeute von 3% wurde dabei beobachtet.
Die Anwendung der Dyade PAT in Einzelmolekülmessungen bestand unter anderem in der Bestimmung von niedrigen Diffusionskoeffizienten (D < 10-19 m2s-1). Die Dyade wurde dazu in PBMA (MW = 14500 g/mol) eingebettet und Messungen an einem Zwei-Farben-Weitfeldmikroskop in einem Temperaturbereich von 24 bis 65 °C durchgeführt. Die Anregung der Fluorophore erfolgte abwechselnd durch zwei Laser und die Intensitäten der beiden Farbstoffe konnten getrennt detektiert werden. Damit waren die Zeitspuren von drei Detektionskanälen erfassbar: PDI-, FRET- und TDI-Kanal.
Nach UV-Bestrahlung war die Beobachtung des schwächer werdenden Energietransfers in Intensitätszeitspuren einzelner Moleküle möglich. Aus den PDI- und FRET-Intensitätszeitspuren wurden Diffusionskoeffizienten bei den unterschiedlichen Temperaturen ermittelt. Die so erhaltenen Diffusionskoeffizienten wurden mit denen aus Einzelmolekülverfolgungs-Experimenten verglichen und die Gültigkeit beider Methoden in unterschiedlichen Viskositätsbereichen diskutiert. Es zeigte sich außerdem beim Vergleich mit einem theoretischen Modell (Vogel-Fulcher-Tammann-Hesse-Gleichung), dass die FRET-Methode für 2*10-19 m2s-1 > D > 1*10-21 m2s-1 zuverlässige Werte liefert, während die Einzelmolekülverfolgung erst ab D > 2*10-18 m2s-1 zuverlässig ist. Durch die FRET-Methode sind nun erstmals Diffusionskoeffizienten aus Bereichen höherer Viskosität mittels Fluoreszenzmikroskopie zugänglich.
Darüber hinaus konnte erstmals eine unabhängige Einzelmolekülverfolgung von Donor und Akzeptor nach Photospaltung gezeigt werden. In einen PEA-Film (MW(PEA) = 100000 g/mol) wurde dafür die Dyade PAT eingebettet und ebenfalls am Weitfeldmikroskop untersucht.
In dieser Arbeit wurde außerdem eine Möglichkeit der Hochauflösung durch Einsatz der apolaren Fluoreszenzfarbstoff-Dyade PAT entwickelt. Die Grundlage hierfür ist die Photoschaltbarkeit des Donors PDI. Innerhalb der intakten Dyade wurde zunächst bei Anregung des PDI die Emission des TDI und nach Photobleichen des TDI die PDI-Fluoreszenz beobachtet. Daraufhin folgte das Photobleichen des PDI. Erste grundlegende Untersuchungen der Dyade für Anwendungen in der hochaufgelösten Mikroskopie wurden durchgeführt. Dabei wurden die Zeiten bis zum Photobleichen des PDI innerhalb der Dyade beobachtet. Außerdem wurde der Verlauf der Gesamtzahl der fluoreszierenden PDI innerhalb der Bilderserien analysiert. Somit konnte der Anteil an fluoreszierenden PDI-Molekülen pro Bild bestimmt werden, welcher entscheidend für die Eignung der Dyade für die hochauflösende Mikroskopie ist. Es zeigte sich, dass der Anteil an fluoreszierenden PDI-Molekülen pro Bild zwischen 3,3 und 6% liegt und somit nicht niedrig genug ist. Damit kann zwar eine 1D-Auflösung von etwa 50 nm erzielt werden, für eine 2D-Auflösung ist der Anteil an fluoreszierenden PDI-Molekülen jedoch zu hoch.
Zunächst wurden Vorversuche für FRET-Messungen an Systemen, in denen Donor und Akzeptor einen wohldefinierten Abstand besitzen, durchgeführt. Als Modellsysteme dienten ein markierter, hybridisierter Oligonukleotidstrang und ein markierter Oligonukleotid-Einzelstrang. Die über FRET-Messungen im Ensemble bestimmten Abstände zwischen Donor- und Akzeptorfarbstoff der hybridisierten Probe wurden mit den theoretisch berechneten Abständen sowie mit dem über FRET gemessenen Abstand der beiden Farbstoffe am Einzelstrang verglichen. Es konnten Rückschlüsse auf bevorzugte Farbstofforientierungen, die sich auf Wechselwirkungen mit dem Phosphatrückgrat zurückführen ließen, und auf die relativ starke Krümmung des Einzelstrangs gezogen werden.
Daraufhin wurde eine PDI-Carbonsäure sowie drei Fluoreszenzfarbstoff-Dyaden synthetisiert: Pyrrolopyrrolcyanin-Cumarin-Perylendiimid (SCP), Perylendiimid-Methylphen-acyl-Terrylendiimid (PAT) und Perylendiimid-Methylphenacyl-Pyrrolopyrrolcyanin (PAS).
Die Dyaden wurden in Ensemblemessungen photophysikalisch charakterisiert. In allen drei Dyaden konnte eine quantitative Energieübertragung des Donors auf den Akzeptor beobachtet werden. Für das FRET-Paar PDI/PPCy ergab sich ein Försterradius von 5,4 nm, für PDT/TDI wurden 6,8 nm ermittelt. Mit der Dyade PAT konnten in Spaltungsexperimenten unter UV-Bestrahlung gute Ergebnisse erzielt werden. Eine Spaltungsquantenausbeute von 3% wurde dabei beobachtet.
Die Anwendung der Dyade PAT in Einzelmolekülmessungen bestand unter anderem in der Bestimmung von niedrigen Diffusionskoeffizienten (D < 10-19 m2s-1). Die Dyade wurde dazu in PBMA (MW = 14500 g/mol) eingebettet und Messungen an einem Zwei-Farben-Weitfeldmikroskop in einem Temperaturbereich von 24 bis 65 °C durchgeführt. Die Anregung der Fluorophore erfolgte abwechselnd durch zwei Laser und die Intensitäten der beiden Farbstoffe konnten getrennt detektiert werden. Damit waren die Zeitspuren von drei Detektionskanälen erfassbar: PDI-, FRET- und TDI-Kanal.
Nach UV-Bestrahlung war die Beobachtung des schwächer werdenden Energietransfers in Intensitätszeitspuren einzelner Moleküle möglich. Aus den PDI- und FRET-Intensitätszeitspuren wurden Diffusionskoeffizienten bei den unterschiedlichen Temperaturen ermittelt. Die so erhaltenen Diffusionskoeffizienten wurden mit denen aus Einzelmolekülverfolgungs-Experimenten verglichen und die Gültigkeit beider Methoden in unterschiedlichen Viskositätsbereichen diskutiert. Es zeigte sich außerdem beim Vergleich mit einem theoretischen Modell (Vogel-Fulcher-Tammann-Hesse-Gleichung), dass die FRET-Methode für 2*10-19 m2s-1 > D > 1*10-21 m2s-1 zuverlässige Werte liefert, während die Einzelmolekülverfolgung erst ab D > 2*10-18 m2s-1 zuverlässig ist. Durch die FRET-Methode sind nun erstmals Diffusionskoeffizienten aus Bereichen höherer Viskosität mittels Fluoreszenzmikroskopie zugänglich.
Darüber hinaus konnte erstmals eine unabhängige Einzelmolekülverfolgung von Donor und Akzeptor nach Photospaltung gezeigt werden. In einen PEA-Film (MW(PEA) = 100000 g/mol) wurde dafür die Dyade PAT eingebettet und ebenfalls am Weitfeldmikroskop untersucht.
In dieser Arbeit wurde außerdem eine Möglichkeit der Hochauflösung durch Einsatz der apolaren Fluoreszenzfarbstoff-Dyade PAT entwickelt. Die Grundlage hierfür ist die Photoschaltbarkeit des Donors PDI. Innerhalb der intakten Dyade wurde zunächst bei Anregung des PDI die Emission des TDI und nach Photobleichen des TDI die PDI-Fluoreszenz beobachtet. Daraufhin folgte das Photobleichen des PDI. Erste grundlegende Untersuchungen der Dyade für Anwendungen in der hochaufgelösten Mikroskopie wurden durchgeführt. Dabei wurden die Zeiten bis zum Photobleichen des PDI innerhalb der Dyade beobachtet. Außerdem wurde der Verlauf der Gesamtzahl der fluoreszierenden PDI innerhalb der Bilderserien analysiert. Somit konnte der Anteil an fluoreszierenden PDI-Molekülen pro Bild bestimmt werden, welcher entscheidend für die Eignung der Dyade für die hochauflösende Mikroskopie ist. Es zeigte sich, dass der Anteil an fluoreszierenden PDI-Molekülen pro Bild zwischen 3,3 und 6% liegt und somit nicht niedrig genug ist. Damit kann zwar eine 1D-Auflösung von etwa 50 nm erzielt werden, für eine 2D-Auflösung ist der Anteil an fluoreszierenden PDI-Molekülen jedoch zu hoch.
Summary in another language
Subject (DDC)
540 Chemistry
Keywords
Fluoreszenz-Resonanz-Energie-Transfer,Einzelmolekülmikroskopie,Fluoreszenzfarbstoff-Dyade,photolabile Linker,Weitfeldmikroskopie,Diffusionskoeffizientenbestimmung
Conference
Review
undefined / . - undefined, undefined. - (undefined; undefined)
Cite This
ISO 690
DILL, Maren, 2014. Synthese, Charakterisierung und Anwendungen photospaltbarer Fluoreszenzfarbstoff-Dyaden mit intramolekularer Energieübertragung [Dissertation]. Konstanz: University of KonstanzBibTex
@phdthesis{Dill2014Synth-28849, year={2014}, title={Synthese, Charakterisierung und Anwendungen photospaltbarer Fluoreszenzfarbstoff-Dyaden mit intramolekularer Energieübertragung}, author={Dill, Maren}, address={Konstanz}, school={Universität Konstanz} }
RDF
<rdf:RDF xmlns:dcterms="http://purl.org/dc/terms/" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/" xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" xmlns:bibo="http://purl.org/ontology/bibo/" xmlns:dspace="http://digital-repositories.org/ontologies/dspace/0.1.0#" xmlns:foaf="http://xmlns.com/foaf/0.1/" xmlns:void="http://rdfs.org/ns/void#" xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#" > <rdf:Description rdf:about="https://kops.uni-konstanz.de/server/rdf/resource/123456789/28849"> <dspace:isPartOfCollection rdf:resource="https://kops.uni-konstanz.de/server/rdf/resource/123456789/29"/> <dcterms:issued>2014</dcterms:issued> <dc:rights>terms-of-use</dc:rights> <dc:language>deu</dc:language> <dcterms:hasPart rdf:resource="https://kops.uni-konstanz.de/bitstream/123456789/28849/1/Dill_288492.pdf"/> <dc:creator>Dill, Maren</dc:creator> <dcterms:rights rdf:resource="https://rightsstatements.org/page/InC/1.0/"/> <dc:contributor>Dill, Maren</dc:contributor> <dcterms:title>Synthese, Charakterisierung und Anwendungen photospaltbarer Fluoreszenzfarbstoff-Dyaden mit intramolekularer Energieübertragung</dcterms:title> <dspace:hasBitstream rdf:resource="https://kops.uni-konstanz.de/bitstream/123456789/28849/1/Dill_288492.pdf"/> <void:sparqlEndpoint rdf:resource="http://localhost/fuseki/dspace/sparql"/> <dcterms:abstract xml:lang="deu">Diese Arbeit beschreibt die Entwicklung neuer photospaltbarer Fluoreszenzfarbstoff-Dyaden. Der Fokus lag dabei in der Anwendung für materialwissenschaftliche Fragestellungen. Bei den hier beschriebenen Fluoreszenzfarbstoff-Dyaden handelt es sich um ein System aus zwei Fluoreszenzfarbstoffen, die über einen photolabilen Linker verbunden sind. Mittels einer durch UV-Licht induzierten Photoreaktion kann der Linker gespalten werden. Die Farbstoffe der Dyade sind so gewählt, dass zwischen ihnen Förster-Resonanz-Energie-Transfer (FRET) auftreten kann. Es wurden Dyaden mit intramolekularer Energieübertragung synthetisiert, photophysikalisch charakterisiert und in Einzelmolekülexperimenten angewandt.<br />Zunächst wurden Vorversuche für FRET-Messungen an Systemen, in denen Donor und Akzeptor einen wohldefinierten Abstand besitzen, durchgeführt. Als Modellsysteme dienten ein markierter, hybridisierter Oligonukleotidstrang und ein markierter Oligonukleotid-Einzelstrang. Die über FRET-Messungen im Ensemble bestimmten Abstände zwischen Donor- und Akzeptorfarbstoff der hybridisierten Probe wurden mit den theoretisch berechneten Abständen sowie mit dem über FRET gemessenen Abstand der beiden Farbstoffe am Einzelstrang verglichen. Es konnten Rückschlüsse auf bevorzugte Farbstofforientierungen, die sich auf Wechselwirkungen mit dem Phosphatrückgrat zurückführen ließen, und auf die relativ starke Krümmung des Einzelstrangs gezogen werden.<br /><br /><br />Daraufhin wurde eine PDI-Carbonsäure sowie drei Fluoreszenzfarbstoff-Dyaden synthetisiert: Pyrrolopyrrolcyanin-Cumarin-Perylendiimid (SCP), Perylendiimid-Methylphen-acyl-Terrylendiimid (PAT) und Perylendiimid-Methylphenacyl-Pyrrolopyrrolcyanin (PAS).<br />Die Dyaden wurden in Ensemblemessungen photophysikalisch charakterisiert. In allen drei Dyaden konnte eine quantitative Energieübertragung des Donors auf den Akzeptor beobachtet werden. Für das FRET-Paar PDI/PPCy ergab sich ein Försterradius von 5,4 nm, für PDT/TDI wurden 6,8 nm ermittelt. Mit der Dyade PAT konnten in Spaltungsexperimenten unter UV-Bestrahlung gute Ergebnisse erzielt werden. Eine Spaltungsquantenausbeute von 3% wurde dabei beobachtet.<br />Die Anwendung der Dyade PAT in Einzelmolekülmessungen bestand unter anderem in der Bestimmung von niedrigen Diffusionskoeffizienten (D < 10-19 m2s-1). Die Dyade wurde dazu in PBMA (MW = 14500 g/mol) eingebettet und Messungen an einem Zwei-Farben-Weitfeldmikroskop in einem Temperaturbereich von 24 bis 65 °C durchgeführt. Die Anregung der Fluorophore erfolgte abwechselnd durch zwei Laser und die Intensitäten der beiden Farbstoffe konnten getrennt detektiert werden. Damit waren die Zeitspuren von drei Detektionskanälen erfassbar: PDI-, FRET- und TDI-Kanal.<br /><br />Nach UV-Bestrahlung war die Beobachtung des schwächer werdenden Energietransfers in Intensitätszeitspuren einzelner Moleküle möglich. Aus den PDI- und FRET-Intensitätszeitspuren wurden Diffusionskoeffizienten bei den unterschiedlichen Temperaturen ermittelt. Die so erhaltenen Diffusionskoeffizienten wurden mit denen aus Einzelmolekülverfolgungs-Experimenten verglichen und die Gültigkeit beider Methoden in unterschiedlichen Viskositätsbereichen diskutiert. Es zeigte sich außerdem beim Vergleich mit einem theoretischen Modell (Vogel-Fulcher-Tammann-Hesse-Gleichung), dass die FRET-Methode für 2*10-19 m2s-1 > D > 1*10-21 m2s-1 zuverlässige Werte liefert, während die Einzelmolekülverfolgung erst ab D > 2*10-18 m2s-1 zuverlässig ist. Durch die FRET-Methode sind nun erstmals Diffusionskoeffizienten aus Bereichen höherer Viskosität mittels Fluoreszenzmikroskopie zugänglich.<br />Darüber hinaus konnte erstmals eine unabhängige Einzelmolekülverfolgung von Donor und Akzeptor nach Photospaltung gezeigt werden. In einen PEA-Film (MW(PEA) = 100000 g/mol) wurde dafür die Dyade PAT eingebettet und ebenfalls am Weitfeldmikroskop untersucht.<br /><br /><br />In dieser Arbeit wurde außerdem eine Möglichkeit der Hochauflösung durch Einsatz der apolaren Fluoreszenzfarbstoff-Dyade PAT entwickelt. Die Grundlage hierfür ist die Photoschaltbarkeit des Donors PDI. Innerhalb der intakten Dyade wurde zunächst bei Anregung des PDI die Emission des TDI und nach Photobleichen des TDI die PDI-Fluoreszenz beobachtet. Daraufhin folgte das Photobleichen des PDI. Erste grundlegende Untersuchungen der Dyade für Anwendungen in der hochaufgelösten Mikroskopie wurden durchgeführt. Dabei wurden die Zeiten bis zum Photobleichen des PDI innerhalb der Dyade beobachtet. Außerdem wurde der Verlauf der Gesamtzahl der fluoreszierenden PDI innerhalb der Bilderserien analysiert. Somit konnte der Anteil an fluoreszierenden PDI-Molekülen pro Bild bestimmt werden, welcher entscheidend für die Eignung der Dyade für die hochauflösende Mikroskopie ist. Es zeigte sich, dass der Anteil an fluoreszierenden PDI-Molekülen pro Bild zwischen 3,3 und 6% liegt und somit nicht niedrig genug ist. Damit kann zwar eine 1D-Auflösung von etwa 50 nm erzielt werden, für eine 2D-Auflösung ist der Anteil an fluoreszierenden PDI-Molekülen jedoch zu hoch.</dcterms:abstract> <dc:date rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#dateTime">2014-09-18T11:54:26Z</dc:date> <foaf:homepage rdf:resource="http://localhost:8080/"/> <bibo:uri rdf:resource="http://kops.uni-konstanz.de/handle/123456789/28849"/> <dcterms:isPartOf rdf:resource="https://kops.uni-konstanz.de/server/rdf/resource/123456789/29"/> </rdf:Description> </rdf:RDF>
Internal note
xmlui.Submission.submit.DescribeStep.inputForms.label.kops_note_fromSubmitter
Examination date of dissertation
August 1, 2014