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OPTIMAS-DW, MetaCrop and VANTED : a Case Study for Data Integration, Curation and Visualisation in Life Sciences

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Datum

2013

Autor:innen

Colmsee, Christian
Czauderna, Tobias
Grafahrend-Belau, Eva
Hartmann, Anja
Lange, Matthias
Mascher, Martin
Weise, Stephan
Scholz, Uwe

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Publikationstyp
Beitrag zu einem Konferenzband
Publikationsstatus
Published

Erschienen in

HORBACH, Matthias, ed.. Informatik angepasst an Mensch, Organisation und Umwelt : Tagung vom 16. – 20. September 2013 in Koblenz. Bonn: Ges. für Informatik, 2013, pp. 1834-1840. Gesellschaft für Informatik: GI-Edition / Proceedings. 220. ISSN 1617-5468. ISBN 978-3-88579-614-5

Zusammenfassung

Since the data volume in life sciences has been growing exponentially in recent years, it is indispensable to develop databases and tools for efficient data integration, curation and visualisation. Focusing on data handling in crop plant research, this paper presents an approach, which combines (i) a data warehouse (OPTIMAS-DW) for integrating experimental data, (ii) an information system (MetaCrop) for manually curated biochemical pathways, and (iii) a visualisation software (VANTED) for integrated data visualisation. The functionality and usability of the concept will be illustrated by a use case.

Zusammenfassung in einer weiteren Sprache

Fachgebiet (DDC)
004 Informatik

Schlagwörter

Konferenz

43. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI), 16. Sept. 2013 - 20. Sept. 2013, Koblenz
Rezension
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Forschungsvorhaben

Organisationseinheiten

Zeitschriftenheft

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Zitieren

ISO 690COLMSEE, Christian, Tobias CZAUDERNA, Eva GRAFAHREND-BELAU, Anja HARTMANN, Matthias LANGE, Martin MASCHER, Stephan WEISE, Uwe SCHOLZ, Falk SCHREIBER, 2013. OPTIMAS-DW, MetaCrop and VANTED : a Case Study for Data Integration, Curation and Visualisation in Life Sciences. 43. Jahrestagung der Gesellschaft für Informatik e.V. (GI). Koblenz, 16. Sept. 2013 - 20. Sept. 2013. In: HORBACH, Matthias, ed.. Informatik angepasst an Mensch, Organisation und Umwelt : Tagung vom 16. – 20. September 2013 in Koblenz. Bonn: Ges. für Informatik, 2013, pp. 1834-1840. Gesellschaft für Informatik: GI-Edition / Proceedings. 220. ISSN 1617-5468. ISBN 978-3-88579-614-5
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2017-04-27

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