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Investigations into the interplay between the ubiquitin-like modifier FAT10 and the E3 ligases HUWE1 or CHIP

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2023

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9. Mai 2025

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Publikationstyp
Dissertation
Publikationsstatus
Published

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Zusammenfassung

Das Ubiquitin-ähnliche Protein FAT10 ist an vielen verschiedenen zellulären Prozessen beteiligt. Dabei spielen sowohl kovalente als auch nicht-kovalente Wechselwirkungen mit FAT10 eine Rolle und führen neben dem proteasomalen Abbau zu diversen funktionellen Konsequenzen für die FAT10-Interaktionspartner. In der vorliegenden Studie wurde die Funktion der HECT-Typ E3-Ligase HUWE1 als mutmaßliche E3-Ligase für FAT10 sowie als FAT10-Konjugationssubstrat untersucht. Dabei wurde HUWE1 als neuer kovalenter und nicht kovalenter FAT10-Interaktionspartner identifiziert. Die Daten zeigten, dass HUWE1 in einer FAT10-Diglycin-abhängigen Weise über die FAT10-Konjugationskaskade in Zellen und in vitro FAT10yliert wird und dass dies HUWE1 dem proteasomalen Abbau zuführt. Da jedoch Cystein-Mutationen innerhalb der katalytischen Domäne von HUWE1 die Interaktion mit FAT10 nicht verhinderten und da HUWE1 weder die Gesamt-FAT10-Konjugation beeinflusste noch spezifisch die FAT10ylierung eines Substratproteins vermittelte, deuten die Daten eher auf eine Funktion von HUWE1 als spezifisches Substrat von FAT10 hin als auf eine Funktion als E3-Ligase für die FAT10-Konjugation. Darüber hinaus wurde festgestellt, dass das mit HUWE1 interagierende Protein AMBRA1 ebenfalls nicht-kovalent mit FAT10 interagierte, was Hinweise auf eine Beteiligung von FAT10 an der HUWE1-abhängigen AMBRA1-vermittelten Mitophagie liefert. Außerdem wurden funktionelle Konsequenzen der FAT10-Bindung an die U-Box E3-Ligase CHIP als neues Substrat und nicht-kovalenter Interaktionspartner untersucht. Die Daten zeigten eine kovalente Modifikation von CHIP mit FAT10 an verschiedenen Bindungsstellen sowie einen proteasomalen Abbau von FAT10yliertem CHIP. Durch die nicht-kovalente Wechselwirkung schien FAT10 die Chaperon-abhängige CHIP-Aktivität zur Ubiquitinierung eines hitzedenaturierten Modellsubstrats in vitro negativ zu beeinflussen. Somit liefert diese Studie Hinweise auf eine Funktion von FAT10 bei der Qualitätskontrolle ungefalteter und fehlgefalteter Proteine.

Zusammenfassung in einer weiteren Sprache

The ubiquitin-like protein FAT10 is involved in many different cellular processes. Here, both covalent and non-covalent interactions with FAT10 play a role and, besides proteasomal degradation, result in various functional consequences for the FAT10 interaction partners. In the present study, the function of the HECT type E3 ligase HUWE1 was investigated as putative E3 ligase for FAT10 as well as FAT10 conjugation substrate. Here, HUWE1 was identified as new covalent and non-covalent FAT10 interaction partner. The data revealed that HUWE1 becomes FAT10ylated in a FAT10 diglycine-dependent manner via the FAT10 conjugation cascade in cellulo and in vitro, and that this targets HUWE1 to proteasomal degradation. However, since cysteine mutations within the HUWE1 catalytic domain did not abrogate interaction with FAT10, and since HUWE1 did not influence bulk FAT10 conjugation nor specifically mediate FAT10ylation of a substrate protein, the data point rather to a function of HUWE1 as a specific substrate of FAT10 than to a function as an E3 ligase for FAT10 conjugation. Moreover, the HUWE1-interacting protein AMBRA1 was identified to non-covalently interact with FAT10 as well, thus providing evidence for an involvement of FAT10 in HUWE1-dependent AMBRA1-mediated mitophagy. Apart from this, functional consequences of FAT10 binding to the U-box E3 ligase CHIP as new substrate and non-covalent interaction partner were investigated. The data showed covalent modification of CHIP with FAT10 at different binding sites as well as proteasomal degradation of FAT10ylated CHIP. By the non-covalent interaction, FAT10 seemed to negatively influence the chaperone-dependent CHIP activity to ubiquitinate a heat-denatured model substrate in vitro. Thus, this study provides evidence for a function of FAT10 in the quality control of unfolded and misfolded proteins.

Fachgebiet (DDC)
570 Biowissenschaften, Biologie

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ISO 690MUELLER, Stefanie, 2023. Investigations into the interplay between the ubiquitin-like modifier FAT10 and the E3 ligases HUWE1 or CHIP [Dissertation]. Konstanz: University of Konstanz
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In der vorliegenden Studie wurde die Funktion der HECT-Typ E3-Ligase HUWE1 als mutmaßliche E3-Ligase für FAT10 sowie als FAT10-Konjugationssubstrat untersucht. Dabei wurde HUWE1 als neuer kovalenter und nicht kovalenter FAT10-Interaktionspartner identifiziert. Die Daten zeigten, dass HUWE1 in einer FAT10-Diglycin-abhängigen Weise über die FAT10-Konjugationskaskade in Zellen und in vitro FAT10yliert wird und dass dies HUWE1 dem proteasomalen Abbau zuführt. Da jedoch Cystein-Mutationen innerhalb der katalytischen Domäne von HUWE1 die Interaktion mit FAT10 nicht verhinderten und da HUWE1 weder die Gesamt-FAT10-Konjugation beeinflusste noch spezifisch die FAT10ylierung eines Substratproteins vermittelte, deuten die Daten eher auf eine Funktion von HUWE1 als spezifisches Substrat von FAT10 hin als auf eine Funktion als E3-Ligase für die FAT10-Konjugation. Darüber hinaus wurde festgestellt, dass das mit HUWE1 interagierende Protein AMBRA1 ebenfalls nicht-kovalent mit FAT10 interagierte, was Hinweise auf eine Beteiligung von FAT10 an der HUWE1-abhängigen AMBRA1-vermittelten Mitophagie liefert.
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Prüfungsdatum der Dissertation

April 21, 2023
Hochschulschriftenvermerk
Konstanz, Univ., Diss., 2023
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Corresponding Authors der Uni Konstanz vorhanden
Internationale Co-Autor:innen
Universitätsbibliographie
Ja
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