Das Protein DEK im Chromatin menschlicher Zellen

Abstract

In der vorliegenden Arbeit wurde die DEK-Lokalisation und -Verteilung im Chromatin mittels der Methode des ChIP-Assays und nachfolgender DNA-Analyse untersucht.In den meisten untersuchten Gen-Regionen wurde DEK gleichmäßig verteilt vorgefunden. Weiterhin ist DEK im C4-Element des TOP1-Gens und im Promotorbereich des CD21-Gens angereichert. Hinweise bestehen darauf, dass diese Anreicherung mit der Gen-Expression zusammenhängt. Die Anreicherung im C4-Element des TOP1-Gens ist eher struktur als sequenzspezifisch, da in Bandshiftassays keine bevorzugte Bindung an das C4-Element festgestellt werden konnte. Jedoch könnte die C4-Region durch ihre GC-reiche, umgekehrte Wiederholungssequenz eine stabile kruziforme DNA-Struktur ausbilden.Des weiteren konnte in Kolokalisationsstudien gezeigt werden, dass DEK in aktiven Gen-Bereichen mehr als in inaktiven Gen-Bereichen lokalisiert. Mit der Klonierung und Analyse der DEK-gefällten DNA-Fragmente (DEK-Klone) konnte festgestellt werden, dass DEK innerhalb von Gen-Bereichen und auch an Nicht-Gen-Bereiche bindet.Mit den hier gezeigten Ergebnissen, der DEK-Strukturspezifität an DNA und seiner Fähigkeit, die DNA-Struktur zu verändern (Alexiadis et al., 2000; Waldmann et al., 2002), könnte DEK als Architektur-Protein wie die klassischen HMG-Proteine im Chromatin funktionieren.