Datensatz:

rDNA 18S V9 ASV tables (SWARM) for Tara Pacific Expedition

Vorschaubild

Datum der Erstveröffentlichung

March 18, 2024

Autor:innen

Mahé, Frédéric
Henry, Nicolas
Berney, Cédric
Poulain, Julie
Romac, Sarah
Bourdin, Guillaume
Ruscheweyh, Hans-Joachim

Andere Beitragende

Repositorium der Erstveröffentlichung

Zenodo

Version des Datensatzes

DOI (Link zu den Daten)
https://doi.org/10.5281/zenodo.5041069
Link zur Lizenz
oops

Angaben zur Forschungsförderung

Projekt

Sammlungen

Biologie: Datensätze
Core Facility der Universität Konstanz
Bewerten Sie die FAIRness der Forschungsdaten

Gesperrt bis

Titel in einer weiteren Sprache

Publikationsstatus
Published

Zusammenfassung

This data is the result of the second analysis of the V9 18S rDNA metabarcoding sequencing data from the Tara Pacific expedition. The analysis was conducted using cutadapt, vsearch, swarm and lulu. Please refer to the readme file for more details.

Zusammenfassung in einer weiteren Sprache

Fachgebiet (DDC)
570 Biowissenschaften, Biologie

Schlagwörter

metabarcoding, coral, plankton, tara pacific

Zugehörige Publikationen in KOPS

Vorschaubild
Publikation
Zeitschriftenartikel
Integrative omics framework for characterization of coral reef ecosystems from the Tara Pacific expedition
(2023) Belser, Caroline; Poulain, Julie; Labadie, Karine; Gavory, Frederick; Alberti, Adriana; Guy, Julie; Carradec, Quentin; Voolstra, Christian R.; Hume, Benjamin C. C.; Perna, Gabriela et al.
Erschienen in: Scientific Data. Springer. 2023, 10, 326. eISSN 2052-4463. Verfügbar unter: doi: 10.1038/s41597-023-02204-0
Link zu zugehöriger Publikation
Link zu zugehörigem Datensatz

Zitieren

ISO 690MAHÉ, Frédéric, Nicolas HENRY, Cédric BERNEY, Julie POULAIN, Sarah ROMAC, Guillaume BOURDIN, Hans-Joachim RUSCHEWEYH, Benjamin C. C. HUME, Christian R. VOOLSTRA, 2024. rDNA 18S V9 ASV tables (SWARM) for Tara Pacific Expedition
BibTex
RDF
<rdf:RDF
    xmlns:dcterms="http://purl.org/dc/terms/"
    xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/"
    xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#"
    xmlns:bibo="http://purl.org/ontology/bibo/"
    xmlns:dspace="http://digital-repositories.org/ontologies/dspace/0.1.0#"
    xmlns:foaf="http://xmlns.com/foaf/0.1/"
    xmlns:void="http://rdfs.org/ns/void#"
    xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#" > 
  <rdf:Description rdf:about="https://kops.uni-konstanz.de/server/rdf/resource/123456789/75839">
    <dspace:isPartOfCollection rdf:resource="https://kops.uni-konstanz.de/server/rdf/resource/123456789/71914"/>
    <dc:creator>Henry, Nicolas</dc:creator>
    <dc:creator>Ruscheweyh, Hans-Joachim</dc:creator>
    <dc:creator>Hume, Benjamin C. C.</dc:creator>
    <dcterms:isPartOf rdf:resource="https://kops.uni-konstanz.de/server/rdf/resource/123456789/71914"/>
    <dcterms:title>rDNA 18S V9 ASV tables (SWARM) for Tara Pacific Expedition</dcterms:title>
    <void:sparqlEndpoint rdf:resource="http://localhost/fuseki/dspace/sparql"/>
    <bibo:uri rdf:resource="https://kops.uni-konstanz.de/handle/123456789/75839"/>
    <dcterms:issued>2024-03-18</dcterms:issued>
    <dc:creator>Bourdin, Guillaume</dc:creator>
    <dc:creator>Berney, Cédric</dc:creator>
    <dc:contributor>Mahé, Frédéric</dc:contributor>
    <dc:contributor>Hume, Benjamin C. C.</dc:contributor>
    <dc:contributor>Henry, Nicolas</dc:contributor>
    <foaf:homepage rdf:resource="http://localhost:8080/"/>
    <dcterms:created rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#dateTime">2024-03-18T12:59:16Z</dcterms:created>
    <dc:contributor>Romac, Sarah</dc:contributor>
    <dc:date rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#dateTime">2026-01-22T15:20:34Z</dc:date>
    <dc:creator>Romac, Sarah</dc:creator>
    <dc:contributor>Ruscheweyh, Hans-Joachim</dc:contributor>
    <dc:contributor>Poulain, Julie</dc:contributor>
    <dc:contributor>Berney, Cédric</dc:contributor>
    <dc:contributor>Bourdin, Guillaume</dc:contributor>
    <dc:creator>Voolstra, Christian R.</dc:creator>
    <dc:creator>Mahé, Frédéric</dc:creator>
    <dc:language>eng</dc:language>
    <dcterms:abstract>This data is the result of the second analysis of the V9 18S rDNA metabarcoding sequencing data from the Tara Pacific expedition. The analysis was conducted using cutadapt, vsearch, swarm and lulu. Please refer to the readme file for more details.</dcterms:abstract>
    <dc:creator>Poulain, Julie</dc:creator>
    <dc:contributor>Voolstra, Christian R.</dc:contributor>
    <dcterms:available rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#dateTime">2026-01-22T15:20:34Z</dcterms:available>
  </rdf:Description>
</rdf:RDF>
URL (Link zu den Daten)
  
Prüfdatum der URL
Kommentar zur Publikation
Universitätsbibliographie
 Ja
Diese Publikation teilen