Datensatz:

Molecular Dynamics Simulations of Linear Ubiquitin Dimers

Lade...
Vorschaubild

Datum der Erstveröffentlichung

2025

Autor:innen

Repositorium der Erstveröffentlichung

KonDATA

Version des Datensatzes

Angaben zur Forschungsförderung

Projekt

Core Facility der Universität Konstanz
Bewerten Sie die FAIRness der Forschungsdaten

Gesperrt bis

Titel in einer weiteren Sprache

Publikationsstatus
Published

Zusammenfassung

This dataset contains trajectory data of linear linked ubiquitin dimers (diUb). Each simulation (12x) is 50 ns long and was started from an open (ubiquitin moieties are separated) conformation to give 60 000 samples every 10 ps. Simulations were performed using the GROMACS simulation package v.5 and the GROMOS 54a7 force field.

Zusammenfassung in einer weiteren Sprache

Fachgebiet (DDC)
540 Chemie

Schlagwörter

Chemistry, Molecular Dynamics, Gromacs, Ubiquitin, GROMOS

Zugehörige Publikationen in KOPS

Publikation
Zeitschriftenartikel
Towards a molecular basis of ubiquitin signaling : a dual-scale simulation study of ubiquitin dimers
(2018) Berg, Andrej; Kukharenko, Oleksandra; Scheffner, Martin; Peter, Christine
Erschienen in: PLoS computational biology. 2018, 14(11), e1006589. eISSN 1553-7358. Verfügbar unter: doi: 10.1371/journal.pcbi.1006589
Link zu zugehöriger Publikation
Link zu zugehörigem Datensatz

Zitieren

ISO 690BERG, Andrej, 2025. Molecular Dynamics Simulations of Linear Ubiquitin Dimers
BibTex
RDF
<rdf:RDF
    xmlns:dcterms="http://purl.org/dc/terms/"
    xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/"
    xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#"
    xmlns:bibo="http://purl.org/ontology/bibo/"
    xmlns:dspace="http://digital-repositories.org/ontologies/dspace/0.1.0#"
    xmlns:foaf="http://xmlns.com/foaf/0.1/"
    xmlns:void="http://rdfs.org/ns/void#"
    xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#" > 
  <rdf:Description rdf:about="https://kops.uni-konstanz.de/server/rdf/resource/123456789/74220">
    <dc:contributor>Berg, Andrej</dc:contributor>
    <dspace:isPartOfCollection rdf:resource="https://kops.uni-konstanz.de/server/rdf/resource/123456789/71914"/>
    <void:sparqlEndpoint rdf:resource="http://localhost/fuseki/dspace/sparql"/>
    <dcterms:abstract>This dataset contains trajectory data of linear linked ubiquitin dimers (diUb). Each simulation (12x) is 50 ns long and was started from an open (ubiquitin moieties are separated) conformation to give 60 000 samples every 10 ps. Simulations were performed using the GROMACS simulation package v.5 and the GROMOS 54a7 force field.</dcterms:abstract>
    <dc:language>deu</dc:language>
    <dc:creator>Berg, Andrej</dc:creator>
    <dcterms:isPartOf rdf:resource="https://kops.uni-konstanz.de/server/rdf/resource/123456789/71914"/>
    <dcterms:rights rdf:resource="https://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/legalcode"/>
    <foaf:homepage rdf:resource="http://localhost:8080/"/>
    <dcterms:title>Molecular Dynamics Simulations of Linear Ubiquitin Dimers</dcterms:title>
    <dspace:isPartOfCollection rdf:resource="https://kops.uni-konstanz.de/server/rdf/resource/123456789/71913"/>
    <bibo:uri rdf:resource="https://kops.uni-konstanz.de/handle/123456789/74220"/>
    <dc:contributor>Kukharenko, Oleksandra</dc:contributor>
    <dcterms:issued>2025</dcterms:issued>
    <dcterms:isPartOf rdf:resource="https://kops.uni-konstanz.de/server/rdf/resource/123456789/71913"/>
    <dc:contributor>Peter, Christine</dc:contributor>
    <dcterms:created rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#dateTime">2025-05-14T07:00:32.000Z</dcterms:created>
    <dc:date rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#dateTime">2025-08-05T10:32:12Z</dc:date>
    <dcterms:available rdf:datatype="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#dateTime">2025-08-05T10:32:12Z</dcterms:available>
    <dc:rights>Creative Commons Zero v1.0 Universal</dc:rights>
  </rdf:Description>
</rdf:RDF>
URL (Link zu den Daten)

Prüfdatum der URL

Kommentar zur Publikation

Universitätsbibliographie
Nein
Diese Publikation teilen